论坛元老
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课程介绍:
本套课程适合做生物信息数据分析同学学习,非常全面的一套教程,从零基础开始讲起。
课程目录:
生物信息学讲座-第1讲-vmware安装
生物信息学讲座-第2讲linux安装(vmware版)
生物信息学讲座-第3讲-centos6.2下编译安装R全记录
生物信息学讲座-第4讲-cufflinks安装(包括samtools)
生物信息学讲座-第5讲-tophat2安装(包括bowtie2)
生物信息学讲座-第6讲-bioconductor安装(包括ShortRead,DESeq,edgeR)
生物信息学讲座-第7讲-SRA转FASTQ格式
生物信息学讲座-第8讲-ShortRead使用(重新编译R-2.15.2版)
生物信息学讲座-第9讲-centos6.2 Python2.7安装(保留原python2.6版)
生物信息学讲座-第10讲-numpy,scipy,matplotlib yum安装
生物信息学讲座-第11讲-numpy,scipy等编译安装(python2.7)
生物信息学讲座-第12讲-bowtie2建索引,用fastq文件比对
生物信息学讲座-第13讲-tophat2比对
生物信息学讲座-第14讲-IGV可视化BAM文件
生物信息学讲座-第15讲-Cytoscape插件3DScapeCS(2D图转成3D图)
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